四川尼众佛学院本着佛陀说法之次第而建立了戒学、俱舍、唯识、中观之教学体系,故佛学院课程的设置便是围绕这一体系,循序渐进,由浅入深,先易后难的次第而进行。
同时佛学院除教授上述体系外,并学习天台教仪,以明白天台智大师用“五时八教,一心三观”来判释世尊言教,修行位次之严密完整。“心佛及众生,是三无差别”众生是迷之佛,佛是觉悟之众生。故佛学院授大乘起信论,来提高学僧的本觉与始觉,使之合二为一而成究竟觉。对于南传上座部之法宝清净道论,法句经,也必须研读,来体会禅定之境界。为了使学僧有一个全面的发展与提高,课程以经律论所诠之戒定慧为中心,同时还授古代汉语、佛教文学、英藏语、财会、书法等课程。
总上所述,教学体系之内容包含了三大语系佛典,使学僧了解了佛法的全貌与次第。十分之七的课时研读佛学,十分之三学习文化,以达到佛学,文化知识的全面提高,以适应当今佛教,社会的发展,更好地为佛教事业服务。学修一体——戒为师
佛学院的学僧,必须严格尊守学院各项制度。(如学生守则,课堂、上殿、过堂、会客、请假、卫生、出坡等)。这也是学院的戒。学僧概不应酬经忏佛事,因为佛法不是商品。正因为如此,使得正信修道之道风,精进不懈之学风,与纯净和合之文风在佛学院勃然兴起。做到了学僧生活丛林化,丛林学院化。达到了佛学信仰,修持与知识同步增长的目的。